Le Service de la Coopération transfrontalière et des Affaires européennes (SGZE) est directement rattaché à la Regierungspräsidentin de Fribourg-en-Brisgau. Elle représente le Land dans un grand nombre d'organes (de décision) transfrontaliers. En tant qu'autorité administrative au niveau local, le Regierungspräsidium agit en concertation avec le ministère d'Etat et le ministère de l'intérieur du Bade-Wurtemberg ainsi qu'avec les Regierungspräsidien du Land concernées : le Regierungspräsidium de Tübingen et celui de Karlsruhe. L'Autorité gère le personnel détaché par le Land ainsi que les ressources budgétaires (également pour les partenaires de projet étrangers) pour les institutions et secrétariats transfrontaliers communs (Conférence franco-germano-suisse du Rhin Supérieur, Secrétariat de la Conférence Internationale du Lac de Constance, INFOBEST Kehl/Strasbourg). Depuis 2007, le SGZE est également en charge des affaires européennes du Regierungspräsidium de Fribourg. Ce dernier exerce le contrôle juridique et technique de l'Euro-Institut.